Evaluation de la sécurité d’agents biologiques dans le cadre de demandes règlementaires

Analyse de la séquence du génome entier (WGS) de micro-organismes destinés à l’alimentation humaine et animale, ou utilisés dans des produits phytopharmaceutiques

L’EFSA exige l’analyse de la séquence complète du génome des bactéries et des levures lorsque ces micro-organismes sont utilisés dans la chaîne alimentaire ou comme produits phytopharmaceutiques.

Le séquençage du génome entier (ou WGS) et l’analyse des données basées sur le WGS vont permettre d’identifier, de caractériser et d’effectuer une évaluation approfondie de la sécurité des micro-organismes pour le consommateur européen.

Pour accompagner les industriels dans ces dossiers techniques, nous avons développé un workflow sur mesure qui répond point par point aux exigences de l’EFSA.

Ce workflow intègre un séquençage hautement qualitatif du ou des microorganisme(s) avec des technologies de séquençages dernière génération qui assureront une interprétation des résultats sans ambigüité.

Le rapport final comprendra notamment :

Une recherche des gènes de résistance aux antimicrobiens
Identifier les polymorphismes à l’échelle d’une population, afin de caractériser les mécanismes sous-jacents de l'origine, du développement, de la croissance et de l'évolution des espèces.
Une recherche des gènes de virulence, pathogénicité ou toxicité

Nous pouvons également fournir des analyses similaires pour l’évaluation du statut QPS (présomption qualifiée d’innocuité) d’un microorganisme donné.